Roux-en-Y胃旁路手术（RYGB）已被推荐为患有巴雷特食道（BE）的严重肥胖患者的减肥手术选择。研究表明，RYGB与BE和异形性的退化有关，没有病例显示BE的进展。术后短期内，RYGB可以使一些患者的BE和异形性退化 。另一项研究发现，RYGB在手术后一年以上显著改善了BE的退化和相关的胃食道反流病（GERD）。无论是短段BE还是长段BE，RYGB后都有显著改善 。此外，RYGB还可以减少胃食道反流病的症状，包括心burn、水疱、喘息、喉炎和吸入，同时减少了质子泵抑制剂的使用 。然而，尽管大多数接受RYGB手术的BE患者在随访内镜检查中BE有所缓解或改善，但仍有一部分患者在随访时BE无变化 。